杭州口腔医院始创于1952年，是集临床、教学、科研为一体的大型口腔医院，2008年，鉴于杭州城西地区缺乏较大规模的口腔专科医院，建立杭州口腔医院古翠路门诊部，并在2010年，正式更名为杭州口腔医院城西院区，同时也是杭州医学院存济口腔医学院第三临床学院、西湖区口腔医学继续教育基地、浙江省适龄儿童涂氟&窝沟封闭项目定点医疗机构、杭州西湖区中老年人口腔体检定点医疗机构、中国牙病防治基金会公益项目执行单位等。
依托于杭口七十余年临床沉淀，十七年来，城西院区发展形势良好，总建筑面积近万方，设有18个临床科室，口腔综合治疗椅213台，引进根管治疗显微镜、数字化全景X光机、椅旁及技工CAD/CAM雕磨系统、牙周内窥镜、口内扫描仪、下颌轨迹分析系统、关节震颤分析仪、电子咬合力分析仪、口腔激光治疗系统、口腔CBCT、立体照相和摄影分析系统、数字化口腔种植导航系统、数字化口腔实训系统、数字化虚拟仿真牙医培训系统、仿真机器人模拟教学系统等先进口腔设备，医院年门诊量约40万人次。
2015年，城西院区成立第一家下属分院——海宁分院，位于海宁市南苑路230号；之后先后建立并已经投入使用的有湖州、城北、湖州、和睦、富阳、丁桥、良渚、安吉等十余家分院，随着2025年杭口“航母级”单体院区——紫金港院区（城西总院新址）运营，城西院区已然发展成深耕浙江、规模较大的一家集临床、教学、科研、预防为一体的口腔专科区域集团。在社会各界的关心和帮助下，杭口城西区域集团将不忘初心、砥砺前行，为口腔医学再创辉煌！为服务社会贡献力量！
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